由于克拉霉素主要在肝脏代谢，对肝细胞色素P450酶系统具有抑制作用，可能会抑制其他药物代谢，从而增加其他药物的血药浓度甚至引发毒性反应。如与特非那丁、阿司咪唑、西沙必利或匹莫齐特合用会导致心脏QT间期延长，心律失常和充血性心力衰竭，因此国内说明书禁止克拉霉素与上面四个药物联合使用。
同时，也要注意克拉霉素与他汀类药物的联合，克拉霉素也会抑制他汀类药物的代谢，会增加他汀类药物不良反应发生的风险，临床上曾见过正在服用阿托伐他汀钙片的患者，服用克拉霉素抗幽门螺杆菌治疗后发生了严重的横纹肌溶解症。
总之，克拉霉素作为常用的抗菌药物，它的副作用不可小觑，特别是心血管系统的副作用，而且和很多药物有相互作用，我们需要记住一点，任何药物在使用前都建议先仔细阅读药物说明书，同时最好在专科医生或药师指导下使用，这样才能做到安全用药，合理用药。
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